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2021年3月24日
发表者 kimi1006
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R语言:两组数据关联分析,pheatmap热图和cytoscape网络图 – 简书

R语言:两组数据关联分析,pheatmap热图和cytoscape网络图

0.9642020.05.28 17:56:18字数 543阅读 2,781

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举例展示R语言组学关联分析的方法。宏基因组数据以KO-样品丰度表为例。代谢组数据以metabolite-样品丰度表为例。基本方法[……]

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2021年3月23日
发表者 kimi1006
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R语言:两组数据关联分析,pheatmap热图和cytoscape网络图 – 简书

R语言:两组数据关联分析,pheatmap热图和cytoscape网络图

0.9642020.05.28 17:56:18字数 543阅读 2,775

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举例展示R语言组学关联分析的方法。宏基因组数据以KO-样品丰度表为例。代谢组数据以metabolite-样品丰度表为例。基本方法[……]

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2021年3月22日
发表者 kimi1006
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R做GSEA富集分析

R做GSEA富集分析

22020.06.30 16:30:37字数 577阅读 7,023

首先感谢Y叔的clusterprofiler神包,做富集分析优点是在线爬取数据,结果很可信,但是缺点也是网络问题,网络差点就要等很久,不过GSEA有自带GMT文件,因此下载好离线数据,这些就可以摆脱在线[……]

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