1.一种利用单克隆细胞分选快速获得CRISPR/Cas9基因敲除稳定细胞株的方法,其特征在于:包括如下步骤:
1)确定靶序列:在基因组数据库中找到目标基因DNA序列,然后使用软件CRISPOR获得目标基因的靶位点,选择两个特异性靶位点作为sgRNA靶序列;
2)设计引物:根据步骤1)获得的sgRNA靶序列分别设计引物,并在引物序列的5‘端添加BbsI酶切位点,得sgRNA引物;分别合成sgRNA引物;
3)获得双链的DNA片段:将步骤2)中合成的sgRNA引物组合后退火、磷酸化获得带有粘性末端的双链DNA片段;
4)获得载体DNA片段:使用BbsI酶切pX458质粒,回收线性质粒DNA,获得具有粘性末端的载体DNA片段;
5)获得Cas9-sgRNA表达载体:将步骤3)中得到的带有粘性末端的双链DNA片段分别与步骤4)中得到的具有粘性末端的载体DNA片段混合,加入T4DNA连接酶连接后转化大肠杆菌,培养后挑选大肠杆菌单菌落测序验证,正确的即为Cas9-sgRNA表达载体;
6)将两种Cas9-sgRNA表达载体等质量混合后,通过脂质体介导的转染方式转染细胞系,转染40-80小时后进行单克隆分选;
7)利用流式细胞仪进行单克隆分选,将荧光蛋白阳性细胞按照1个细胞分选到1个孔的方式分选到加了全培养基的微孔板中;进行分选时加Sytox blue核酸染料去除死细胞;
8)培养分选得到的GFP阳性单细胞,增殖后获取细胞基因组DNA;
9)设计包含靶位点目的片段的检测引物,以步骤8)得到细胞基因组DNA为模板进行PCR扩增;鉴定PCR扩增产物,选择CRISPR/Cas9基因敲除细胞株,扩大培养后冻存。
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