JASPAR网站预测启动区域有那些转录因子结合位点

JASPAR网站预测启动区域有那些转录因子结合位点

JASPAR是一个收录转录因子结合位点的网站,网站除了收集结合位点,还可以:

1. 预测蛋白是不是转录因子,查找转录因子的结合位点特征

2. 预测一段序列(启动子区)中有那些转录结合位点

其中预测启动子区的结合位点可以采用网站提供是“Scan” 实现。具体如下:

1. 首先搜索转录因子结合位点,比如搜索人类的所有转录因子结合位点

2.  选择要搜索的转录因子结合位点特征

3. 输入启动子区的序列,点击“Scan” 运行

结果如下:

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TCGA-生存分析

TCGA-基因差异表达分析

TCGA-转录因子调控

TCGA-ceRNA调控网络分析

  • 发表于 2018-07-27 10:14

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  • 分类:转录组

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