循环冻融和不同的保存条件对肿瘤样本组织中RNA、DNA和蛋白质质量的影响

2015-12-01

摘要：

背景：高质量的肿瘤样本组织对实验研究尤其是分子实验至关重要。根据实验室的条件，通常选用不同的存储方法来保证样本组织的质量。但是不同的存储方法对样本组织中RNA、DNA和蛋白质的影响尚不清楚，尤其是针对DNA甲基化程度和蛋白质溶解现象。

方法：我们采用了RNALater稳定液、生理盐水、冰冻切片包埋剂、不加保护剂的速冻（对照组）四种存储方法。在配对组织样本中分析了RNA的质量（包括RIN测定、mRNA表达量测定）、DNA的质量（包括DNA扩增检测、RASSF1a基因甲基化程度测定），以及蛋白质的质量。除此以外，我们还分析了经过三次循环冻融后样本中RNA的质量。

结果：RNALater稳定液处理组在正常情况下和三次循环冻融后均表现出良好的RNA质量（RIN>8）。但是速冻样本组织显示结果较差，一次循环冻融后RIN>7，三次循环冻融后RIN>6。生理盐水和冰冻切片包埋处理组的结果也不甚理想，一次循环冻融后RIN>7，两侧循环冻融后RIN>6。不同的存储方法对DNA扩增的影响非常小，但对DNA甲基化程度和蛋白质的质量还是存在影响。冰冻切片包埋处理组相较于其他两组似乎更加安全稳定，其实验结果与对照组非常相近。

结论：在预算和效率的双重考量下，我们建议冰冻切片包埋剂作为最佳存储方法，它不但可以在循环冻融的的情况下很好的保存RNA, 也可以保证DNA和蛋白质的安全稳定。

作者：Wang Y, et al.【West China Hospital,Sichuan University,China】

编译：王晶，刘世建【上海儿童医学中心生物样本库】

校审：王耀賡【原文作者，四川大学华西医院】

原文出处：

Wang, Y., et al. (2015). "The Impactof Different Preservation Conditions and Freezing-Thawing Cycles on Quality ofRNA, DNA, and Proteins in Cancer Tissue." Biopreserv Biobank 13(5): 335-347.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26484573

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