hello大家好,小月亮又和大家见面了。前几篇软文介绍了免费进行功能富集的在线工具Metascape。本篇文章将介绍一款快速拿到差异基因交集并得到韦恩图的在线工具。
在线工具链接如下:
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/
界面如下,首先是工具的介绍:
1. 此工具可快速拿到几个基因list的交集和差集。最多支持计算30个list的交集和差集。
2. 当基因list数目小于7(小月亮实测,现在支持到5个list的韦恩图绘制),此工具会直接在网页结果界面展示韦恩图,并可以将韦恩图保存为SVG或PNG格式。
3. 引用,可直接引用工具网址。
下面进入实操,此工具支持以两种方式进行基因列表的输入:
txt文件上传
直接将基因粘贴到网站中的基因粘贴框中
放出小月亮的测试实例,测试了5个基因list交集。上传5个基因list后,点击Submit,工具很快生成结果界面:
结果1:列出每个基因list的统计情况,每个list中的基因数目;去掉重复基因之后的基因数目;5个基因list的基因并集的数目。
结果2:韦恩图(点击下图红框中按钮,可选择将韦恩图保存成PNG或SVG格式)
结果3:5个list的交集情况列表:
1. list1-list5,5个基因list的交集。交集基因共12个,具体的基因信息详见表格第一行第三列。
2. list1-list4去除list1-list5交集之后的4个基因list的交集情况。
3. list2-list5去除list1-list5交集之后的4个基因list的交集情况。
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